塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转，并结识了新的伙伴。

ZAP SPACY收到了求救信号，雷等人迅速驾驶盘龙号前往，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，雷他们遇见了其他次元的自己，并且出现了一头机械哥莫拉。原来在这个星球上，莎乐美星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一起。雷召唤的哥莫拉不敌机械哥莫拉，正当危急之际，赛罗奥特曼出现营救。而为了计划的继续进行，莎乐美星人启动了黑暗独眼巨人赛罗。

雷等人在收到求救信号后立即前往救援，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，出现了一头机械哥莫拉。原来是莎乐美星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一起。正当危急之际，赛罗奥特曼出现了。