21世纪初，日本生物科技高度发达，其所研制并独家垄断的生物机器人极大推进了时代的进步，但同时其潜在的危害性也不断受到世界各国的指摘。不满于其他国家对该技术限制的呼声，日本于2067年单方面退出联合国，用高科技手段屏蔽一切外来信号，再次进入锁国状态。此后整整10年间，关于日本的现状外界一无所知。美国政府急于了解日本当前的状况，虽派出特种部队SWORD秘密潜入这个已经封闭了十个年头的神秘国家。当特种队员VEXILLE（黒木メイサ音）和里昂（谷原章介饰）进入日本后，眼前的一切却令他们大吃一惊……

清朝末年，虎视眈眈的外国列强不断进犯，长年闭关锁国的清政府愈发无力反抗，英日侵略者相互勾结，妄图侵占广州城。几位武者临危受命，历经艰难险阻，击败日本忍者，利用秘密防御工事，逼退英战舰，挽救广州城。